通风柜的排风系统(system)可分为集中式和分散式两种。集中式是把一层楼面或几层楼面的的通风柜组成一个系统，或者整个实验楼分成一二个系统。它的特点是通风机（Draught Fan）少，设备投资（意义：是未来收益的累积）省，而且对通风柜的数量稍有增减，以及位置的变更，都具有一定的适应性。然而由于系统较大，风量不易平衡，尽管每个通风柜上都装有调节阀，但使用不方便，并且也不容易达到预定的效果。如果系统风管损坏需要检修时，那么整个系统的通风柜就没有办法使用。所以，原来采用集中式系统的实验室，先后都改为用分散式系统。
分散式是把一个通风柜或同房间的几个通风柜组成一个排风系统。P4实验室结构和设施、安全操作规程、安全设备适用于对人体具有高度的危险性，通过气溶胶途径传播或传播途径不明，尚无有效的疫苗或治疗方法的致病微生物及其毒素。他的特点是：可根据通风柜的工作需要来启闭通风机，相互不受干扰，容易达到预定的效果，而且比集中式节省(spare)能源，因为集中式系统，只要一个通风柜在使用，就得开动大通风机。分散式由于系统小，排风量也小，阻力也小，所以通风机的风量、风压都不大，躁声与振动相应也较小。分散式还有一个特点，是对排出不同性质的有害气体易于处理。缺点是通风机的数量多、系统多，如果通风机集中于通风机房内，那么投资就会增大，如果通风机分散布置，而且就地安装，虽然通风机的投资增加，但风管的投资可节省，最后总投资不一定增大。建议使用分散式。 在划分系统时，同一个房间内如有两个以上的通风柜，应划为一个系统，避免一个通风柜在使用，其他的通风柜产生倒流，使室内受到感染。同样，一个房间内除了一个排风系统外，不宜再装置其他排风设备。
工厂实验室排风系统的通风机（Draught Fan），一般都装在屋顶上，或顶层的通风机房内，这样可不占用使用面积，而且使室内的排风管道处于负压状态，以免有害物质由于管道的腐蚀或损坏，以及由于管道不严密而渗入室内，此外，通风机安装在屋顶上或顶层的通风机房内，检修方便，易于消声或减振。实验室设备实验脊椎动物生物安全防护实验室，其适用微生物范围与同级的一般生物安全防护实验室相同。
排风系统(system)有害物质排放高度应按现行的《工业公司设计卫生标准》和《工业三废排放标准》执行。实验室设备每类生物安全防护实验室根据所处理的微生物及其毒素的危害程度各分为四级。各级实验室的生物安全防护要求依次为：一级最低，四级最高。在一般情况下，如果附近五十米以内没有比较高建筑物时，排放高度应超过建筑物最高处两米以上。
