一般原则要求：P3实验室内，在保证实验质量的同时，更要保证操作人员安全，杜绝环境污染。洁净实验室主要用于微生物学、生物医学、生物化学、动物实验、基因重组以及生物制品等研究使用的实验室统称洁净实验室-生物安全实验室。无菌试验室、生物安全实验室由主实功能验室与其他实验室及辅助功能用房组成。因此，实验室内在保证一定的洁净度条件下，必须呈现一定的负压，确保室内污染气体不泄漏。并要对室内污染物和气体进行处理排放。
P3实验（experiment)室建筑布局
P3实验（experiment)室要与公共通道口隔离。实验室净化由于洁净实验室-生物安全实验室内操作对象是危险性的微生物，对人体、动植物或环境具有危害，必须通过采用合理的空气调节系统，保持洁净实验室-生物安全实验室的相对负压环境无论何时都不被破坏，以保证实验室内危险性微生物不能向外部环境中扩散。从走廊入口或其他相邻的实验室进人该实验室须通过两道自动关闭的门。通道里有更衣室（可随时淋浴）。实验室人流物流要分开。人流是指进入实验室操作人员必须通过淋浴室一更衣室（正压气闸（zhá)室）更换工作服一清洁走廊～负压气闸室～实验室。离开实验室顺序与进入相反。物流是指所有进入实验室的物品必须经过另一清洁走廊的传递窗进入，相反实验室内的物品必须消毒处理后，再经过传递窗传出。
1、气压与气体排放
要备有真空系统设施，以保障实验室内绝对的负压。这一设施产生从清洁区到实验室污染区的定向气流。排出室外的空气不准在建筑物内其他区域循环（continue)使用，而必须经过过滤和其他处理程序(procedure)排出。实验室内各处的压力梯度和洁净度分别为淋浴室的压力为常压；正压气闸室压力为高于常压+10Pa、洁净度为十万级；清洁走廊压力为-10Pa、洁净度为十万级；负压气闸室压力为-20Pa、洁净度为十万级；P3负压实验室压力为-30Pa、洁净度为万级（较好的可达五千级）。
经过二或三级生物安全高效粒子空气过滤器(作用:过滤杂质等)（过滤效率(efficiency)99.995％）过滤的气体，可直接或通过建筑物(building)排气系统排出。通过建筑物排气系统排出时，高效粒子空气过滤器要以某种方式（如套简装置连接）连接到该系统上，以免影响生物安全柜或建筑物排气系统的气流不平衡。使用二级生物安全柜应至少12个月检测、鉴定1次，排出的气体可以在实验（experiment)室内循环。安全柜内有可以产生气溶胶的连续（Continuity)运行的离心机或其他仪器（appliance），气体在进入实验室或周围环境之前，要通过高效粒子空气过滤器过滤。
用液体消毒装置和高效粒子空气过滤器(作用:过滤杂质等)或采取其他相应的设备来保护真空系统，这些防护设备应便于经常维护及时更换。负压气闸（zhá)室门与负压实验（experiment)室门要互锁，以保证操作人员进出时，实验室与外界相对隔绝，以免污染区负压大幅回升，室内气体外泄。
2、其他设施
P3实验（experiment)室均应备有洗手池。净化实验室控制系统是整个洁净实验室安全运行的神经中枢,由于洁净实验室-生物安全实验室的实验对象是危险性的微生物，出于严格控制污染的原则，它要求以最少的维护人员，运用最优化的管理维护手段，来实时监控每一个实验室中设备所处的物理环境，保证实验室运行过程中始终处于相对负压环境，防止危险性微生物外泄。其出水控制（control)开关应是脚踩式、肘动式或自动开关式，固定在实验室出口附近。墙的内表面、墙的地脚、地面和天花板应光洁、防水，以便于清洗。这些表面上的渗漏(seepage)处要密封，以便于进行空间消毒。如果实验室要留窗子，一定要双层玻璃，以保证绝对密封。实验室空间要根据需要而定；实验室物品要固定存放位置（position )，工作台、操作柜和设备之间要便于清扫。工作台面应不渗水、耐酸碱(acid-base)、耐有机溶剂(性状:透明、无色的液体)和中等度耐热。实验室必要时可留有下水道，平时对外界密封。实验室内排出的污水必须经过严格消毒处理方可排出。
